MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. CCGE1003 chromosome 2

Total Repeats: 73331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014540	TAT	2	6	5	10	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014540	TCC	2	6	98	103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014540	TA	3	6	258	263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014540	CGCTG	2	10	313	322	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014540	AAC	2	6	395	400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014540	GCG	2	6	490	495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014540	GC	3	6	504	509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014540	GCG	2	6	512	517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014540	TCG	2	6	534	539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014540	ACA	2	6	574	579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014540	CTGA	2	8	595	602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014540	GC	3	6	623	628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014540	CGG	2	6	715	720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014540	GTC	2	6	782	787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014540	CG	3	6	822	827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014540	GGC	2	6	828	833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014540	ACG	2	6	854	859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014540	GCC	2	6	868	873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_014540	CGA	2	6	891	896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014540	CTC	2	6	924	929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014540	ATCT	2	8	934	941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014540	CCG	2	6	982	987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014540	CGA	2	6	1002	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014540	GCA	2	6	1011	1016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014540	CAA	3	9	1047	1055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014540	CAA	2	6	1059	1064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014540	GCC	2	6	1068	1073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014540	CTCA	2	8	1083	1090	25 %	25 %	0 %	50 %	307725551
29	NC_014540	CTG	2	6	1117	1122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725551
30	NC_014540	GAT	2	6	1129	1134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307725551
31	NC_014540	GGT	2	6	1158	1163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307725551
32	NC_014540	CGA	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725551
33	NC_014540	GTA	2	6	1180	1185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307725551
34	NC_014540	TCG	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725551
35	NC_014540	TGATCG	2	12	1332	1343	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307725551
36	NC_014540	GCAG	2	8	1425	1432	25 %	0 %	50 %	25 %	307725551
37	NC_014540	GCTC	2	8	1446	1453	0 %	25 %	25 %	50 %	307725551
38	NC_014540	GAG	2	6	1461	1466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307725551
39	NC_014540	TTC	2	6	1475	1480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307725551
40	NC_014540	GGCG	2	8	1486	1493	0 %	0 %	75 %	25 %	307725551
41	NC_014540	TGA	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307725551
42	NC_014540	CGT	2	6	1578	1583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725551
43	NC_014540	ACC	3	9	1619	1627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307725551
44	NC_014540	GCG	2	6	1691	1696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725551
45	NC_014540	CG	3	6	1730	1735	0 %	0 %	50 %	50 %	307725551
46	NC_014540	CTT	2	6	1785	1790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307725551
47	NC_014540	CAG	2	6	1852	1857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725551
48	NC_014540	GCC	2	6	1881	1886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725551
49	NC_014540	CGC	2	6	1930	1935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725551
50	NC_014540	TTC	2	6	2071	2076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014540	GGA	2	6	2130	2135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014540	CATG	2	8	2141	2148	25 %	25 %	25 %	25 %	307725552
53	NC_014540	CGGG	2	8	2200	2207	0 %	0 %	75 %	25 %	307725552
54	NC_014540	TGT	2	6	2228	2233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307725552
55	NC_014540	GC	3	6	2254	2259	0 %	0 %	50 %	50 %	307725552
56	NC_014540	TGCG	2	8	2305	2312	0 %	25 %	50 %	25 %	307725552
57	NC_014540	GAAG	2	8	2381	2388	50 %	0 %	50 %	0 %	307725552
58	NC_014540	TCA	2	6	2419	2424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307725552
59	NC_014540	CGT	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725552
60	NC_014540	TCA	2	6	2569	2574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307725552
61	NC_014540	CGT	2	6	2578	2583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725552
62	NC_014540	CG	3	6	2591	2596	0 %	0 %	50 %	50 %	307725552
63	NC_014540	GGC	2	6	2604	2609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725552
64	NC_014540	CAG	2	6	2648	2653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725552
65	NC_014540	ACG	2	6	2686	2691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725552
66	NC_014540	CGC	2	6	2752	2757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725552
67	NC_014540	CGC	2	6	2809	2814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725552
68	NC_014540	GTTCCT	2	12	2831	2842	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307725552
69	NC_014540	GCC	2	6	2850	2855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725552
70	NC_014540	ATC	2	6	2880	2885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307725552
71	NC_014540	CGG	2	6	2894	2899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725552
72	NC_014540	AAC	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307725553
73	NC_014540	GGC	2	6	3036	3041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725553
74	NC_014540	TGCA	2	8	3044	3051	25 %	25 %	25 %	25 %	307725553
75	NC_014540	CCG	2	6	3083	3088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725553
76	NC_014540	ATC	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307725553
77	NC_014540	GCG	2	6	3180	3185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725553
78	NC_014540	CAG	2	6	3215	3220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725553
79	NC_014540	GAA	2	6	3252	3257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307725553
80	NC_014540	CAG	2	6	3369	3374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725553
81	NC_014540	GT	3	6	3380	3385	0 %	50 %	50 %	0 %	307725553
82	NC_014540	GAA	2	6	3400	3405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307725553
83	NC_014540	ATC	2	6	3448	3453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307725553
84	NC_014540	ACA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307725553
85	NC_014540	CG	3	6	3566	3571	0 %	0 %	50 %	50 %	307725553
86	NC_014540	GAC	2	6	3573	3578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725553
87	NC_014540	CGA	2	6	3681	3686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725553
88	NC_014540	GAC	2	6	3762	3767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725553
89	NC_014540	GAA	2	6	3783	3788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307725553
90	NC_014540	GCGA	2	8	3817	3824	25 %	0 %	50 %	25 %	307725553
91	NC_014540	GCC	2	6	3828	3833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725553
92	NC_014540	TTC	2	6	3857	3862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307725553
93	NC_014540	GC	3	6	3863	3868	0 %	0 %	50 %	50 %	307725553
94	NC_014540	CAG	2	6	3901	3906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725553
95	NC_014540	AAG	2	6	3922	3927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014540	GGC	2	6	3985	3990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014540	GCCC	2	8	4016	4023	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_014540	GC	3	6	4098	4103	0 %	0 %	50 %	50 %	307725554
99	NC_014540	CTGC	2	8	4104	4111	0 %	25 %	25 %	50 %	307725554
100	NC_014540	CGT	2	6	4144	4149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725554
101	NC_014540	TAGC	2	8	4151	4158	25 %	25 %	25 %	25 %	307725554
102	NC_014540	CGG	2	6	4167	4172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725554
103	NC_014540	CGG	2	6	4185	4190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725554
104	NC_014540	CGAA	2	8	4308	4315	50 %	0 %	25 %	25 %	307725554
105	NC_014540	AAC	2	6	4348	4353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307725554
106	NC_014540	CTGT	2	8	4382	4389	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014540	GGC	2	6	4394	4399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014540	CCGAC	2	10	4477	4486	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_014540	GC	3	6	4521	4526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014540	C	6	6	4592	4597	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_014540	TG	3	6	4611	4616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014540	GTC	2	6	4622	4627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014540	GT	3	6	4790	4795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014540	ACC	2	6	4840	4845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307725555
115	NC_014540	CCA	2	6	4888	4893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307725555
116	NC_014540	GCCT	2	8	4919	4926	0 %	25 %	25 %	50 %	307725555
117	NC_014540	GCA	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725555
118	NC_014540	CTT	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307725555
119	NC_014540	GCA	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725555
120	NC_014540	GTC	2	6	4973	4978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725555
121	NC_014540	GCAG	2	8	5014	5021	25 %	0 %	50 %	25 %	307725555
122	NC_014540	CTC	2	6	5036	5041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307725555
123	NC_014540	ACGC	2	8	5051	5058	25 %	0 %	25 %	50 %	307725555
124	NC_014540	GCG	2	6	5080	5085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725555
125	NC_014540	GAA	2	6	5093	5098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307725555
126	NC_014540	GCC	2	6	5135	5140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725555
127	NC_014540	CGG	2	6	5170	5175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725555
128	NC_014540	CGC	2	6	5176	5181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725555
129	NC_014540	GCC	2	6	5208	5213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725555
130	NC_014540	GCC	2	6	5244	5249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725555
131	NC_014540	CCTGC	2	10	5278	5287	0 %	20 %	20 %	60 %	307725555
132	NC_014540	CGGC	2	8	5303	5310	0 %	0 %	50 %	50 %	307725555
133	NC_014540	ACG	2	6	5319	5324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725555
134	NC_014540	CG	3	6	5405	5410	0 %	0 %	50 %	50 %	307725555
135	NC_014540	CGA	2	6	5440	5445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725555
136	NC_014540	GTCG	2	8	5453	5460	0 %	25 %	50 %	25 %	307725555
137	NC_014540	CCA	2	6	5462	5467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307725555
138	NC_014540	CGAT	2	8	5499	5506	25 %	25 %	25 %	25 %	307725555
139	NC_014540	CTG	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725555
140	NC_014540	ATC	2	6	5571	5576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307725555
141	NC_014540	GGT	2	6	5612	5617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307725555
142	NC_014540	ACC	2	6	5640	5645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307725555
143	NC_014540	CGGC	2	8	5676	5683	0 %	0 %	50 %	50 %	307725555
144	NC_014540	CG	3	6	5865	5870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014540	TTG	2	6	5905	5910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_014540	CTT	2	6	5933	5938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_014540	CTT	2	6	5946	5951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014540	CAA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014540	TCA	2	6	5984	5989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_014540	GTCG	3	12	6026	6037	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_014540	TGGC	2	8	6066	6073	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_014540	A	8	8	6075	6082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014540	GGC	2	6	6126	6131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_014540	GCT	3	9	6150	6158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_014540	CGA	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725556
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164	NC_014540	TTC	2	6	6552	6557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307725556
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166	NC_014540	CTT	2	6	6578	6583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307725556
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174	NC_014540	CCT	2	6	6788	6793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307725556
175	NC_014540	GTCG	2	8	6822	6829	0 %	25 %	50 %	25 %	307725556
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179	NC_014540	GCG	2	6	6900	6905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725556
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200	NC_014540	ACA	2	6	7412	7417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307725556
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247	NC_014540	A	7	7	8975	8981	100 %	0 %	0 %	0 %	307725558
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257	NC_014540	CGG	3	9	9320	9328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725558
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259	NC_014540	TGA	2	6	9444	9449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_014540	GCG	2	6	10109	10114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725559
272	NC_014540	ACC	2	6	10146	10151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307725559
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276	NC_014540	TGC	2	6	10318	10323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725559
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278	NC_014540	GGC	3	9	10344	10352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725559
279	NC_014540	GC	3	6	10357	10362	0 %	0 %	50 %	50 %	307725559
280	NC_014540	GCGT	2	8	10369	10376	0 %	25 %	50 %	25 %	307725559
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286	NC_014540	TG	3	6	10616	10621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
287	NC_014540	AGC	2	6	10674	10679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725560
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388	NC_014540	GCGCA	2	10	15428	15437	20 %	0 %	40 %	40 %	307725564
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396	NC_014540	CAA	2	6	15569	15574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307725564
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400	NC_014540	CGG	2	6	15733	15738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725564
401	NC_014540	CGC	2	6	15742	15747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725564
402	NC_014540	GCC	2	6	15791	15796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725564
403	NC_014540	CG	3	6	15849	15854	0 %	0 %	50 %	50 %	307725564
404	NC_014540	CGG	2	6	15953	15958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725564
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432	NC_014540	CGC	2	6	17202	17207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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